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龟鳖不是新型冠状病毒的中间宿主。 刘龙、吴建国团队的文章结论依据不足、仓促、不负责任。
林莉 仲恺农业工程学院动物科技学院院长、广东省水生病害监测与综合防治重点技术创新团队首席科学家、广东省水生动物保健协会会长
2020年2月26日,湖北医学院刘龙课题组和暨南大学吴建国课题组(两人为共同通讯作者)在J Med Virol《》发表论文医学病毒学》和《SARS-CoV-2的刺突蛋白和宿主ACE2宿主》的中文翻译是:【冠状病毒刺突蛋白和宿主血管紧张素转换酶2(ACE2)受体的组成和分化预测新型冠状病毒(SARS- CoV-2) 潜在中间宿主]。
网上文章信息截图如下:
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图1. 网上文章信息截图
我来分析一下这篇文章的主要结果:
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摘要()中无红线的部分主要描述研究背景和意义。 红线是主要结果。 红线部分翻译如下:在本研究中,我们系统地比较了冠状病毒刺突蛋白与宿主受体血管紧张素转换酶2(ACE2)的结合域。 将刺突蛋白与宿主受体血管紧张素转换酶 2 (ACE2) 结合的关键氨基酸表明,穿山甲、蛇和龟(锦龟、绿海龟和中华鳖)可能是人类 SARS 的中间体-CoV-2病毒宿主。
文章的结果主要来自于下表中冠状病毒刺突蛋白与宿主受体血管紧张素转换酶2(ACE2)结合的结构域氨基酸的对比:
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图2 不同动物ACE2蛋白与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)结合域的氨基酸序列比较
根据以上结果,作者的主要描述如下图红色部分所示
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红色部分的中文翻译如下: 龟类(西方锦龟、绿海龟、中华龟)、穿山甲和蝙蝠中的这个域与理论上可以感染的物种,如人类、大猩猩和猕猴有5个以上的差异。 。 小鼠和狗有超过五个氨基酸的突变,而猫和仓鼠只有三个突变。
在讨论这篇文章的结果之前,我们先来讨论一下穿山甲是否是新冠病毒的中间宿主? 根据目前学术观点,穿山甲冠状病毒全基因组与新冠病毒全基因组相似度仅为90.3%,穿山甲并不是新冠病毒的中间宿主。
根据以上主要结果,可以得出以下几点:
1.文章作者仅使用生物信息学工具分析从网上下载的序列。 该结果只是一个预测,并没有必要的实验结果支持。 如何解释生物信息学结果需要非常谨慎。
2. 作者尚未从海龟身上分离到任何冠状病毒。 事实上,迄今为止,世界上还没有海龟和海龟感染冠状病毒的先例。 即使分离出冠状病毒,作者仍然需要对分离出的病毒株的整个基因组进行测序。 在目前做出诊断之前,该核苷酸序列与SARS-CoV-2病毒的整个基因组具有非常高的相似度(超过99%)。 结论。
3. 当病毒感染宿主时,其生命周期由八个关键步骤组成:附着、入侵、脱壳、转录、复制、翻译、组装和释放。 任何一个环节出现问题都会导致病毒感染失败。 冠状病毒刺突蛋白与宿主受体血管紧张素转换酶2(ACE2)结合,仅参与病毒的入侵。 而且作者还承认,海龟和海龟的血管紧张素转换酶2(ACE2)和冠状病毒结合域仍然存在5个氨基酸差异。 因此,病毒能否进入龟细胞仍存疑问。 即使进入细胞,龟细胞也必须支持病毒脱壳、转录、复制、翻译、组装和释放这六个关键步骤。 另外,病毒复制需要一定的温度范围。 乌龟和乌龟是冷血动物,而人类是吸温动物。 乌龟在人体正常体温(36摄氏度)下很难生存。
4. 文章作者充分利用穿山甲作为中间宿主的结果来支持他们的预测。 穿山甲是哺乳动物,乌龟是爬行动物。 从分类上来说西部锦龟,穿山甲比龟更接近人类。 现在连穿山甲都不是新冠病毒的中间宿主,龟类的可能性就更小了。
综上所述,可以看出,龟类不太可能是新冠病毒的中间宿主。 湖北医学院和暨南大学团队的结论缺乏基础科学依据。
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